親和層析是一種非常有效的蛋白質純化方法。其分離的機制是基于蛋白質和某些特定分子具有特異性的相互作用。除了生物特異性配體外（如酶底物、抗體、受體等等），一些俗稱為類生物配體（如凝集素、染料）的物質也用在親和層析中，而在固定化的金屬離子上進行的親和層析在蛋白質和多肽的分離純化工作中越來越重要。親和層析的選擇性和效率極高。
特點：
 鍵合有活性的、有特殊官能團的樹脂
 標準的1000Å孔尺寸用于大分子生物聚合物
 配合體決定最終產品的化學穩定性
 TOYOPEARL AF-Tresyl-650M和TOYOPEARL AF-Formyl-650M被推薦用來偶聯蛋白質, 而TOYOPEARL AF-Epoxy-650M適合連結小分子配體, TOYOPEARL AF-Amino-650M和TOYOPEARL AF-Carboxyl-650M既可以偶聯蛋白質也可以用來連接小分子配體