自然資源部海洋生態系統動力學重點實驗室的前身是2005年成立的國家海洋局海洋生態系統與生物地球化學重點實驗室, 在2019年自然資源部考核中位列部屬生態類實驗室第一，并于2020年1月7日正式更名。會上，蘇紀蘭院士和唐啟升院士共同為“自然資源部海洋生態系統動力學重點實驗室”揭牌。

近年來，實驗室形成了科學研究與技術研發緊密結合的發展特色，在極地海洋生物地球化學、大洋生態與生物多樣性、近海環境演變與生態效應等學科發展層面取得了顯著進展；在海洋生態原位觀測與取樣技術、海洋分析測試與生物技術、海洋標準物質研制等能力建設層面得到了明顯提高。

實驗室主任曾江寧研究員做了工作報告，介紹了實驗室定位、研究水平與貢獻、隊伍建設與人才培養、開放交流與運行管理以及新時代實驗室未來方向等情況。學術委員會審議了實驗室報告，肯定了近年來實驗室取得的成績，同時建議實驗室進一步明確定位，落實可持續發展對策，突出優勢方向，深化學科交叉，擴大合作，努力建成特色鮮明的重點實驗室。學術委員會還建議實驗室要加強人才隊伍建設，注重年輕人才的培養，穩定青年研究隊伍；加強實驗室基礎設施建設，提升技術支撐能力。